Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L4Q8WXT5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L4Q8WXT5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms