Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATRIPQ8WXE1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATRIPQ8WXE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms