Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVZ7

RNF133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF133Q8WVZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF133Q8WVZ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF133Q8WVZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF133Q8WVZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms