Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBR1Q8WVP7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBR1Q8WVP7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms