Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB1Q8WTV0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARB1Q8WTV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB1Q8WTV0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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