Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDD1Q8TEB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHBDD1Q8TEB9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms