Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAT3Q8TDW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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