Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN5Q8TD22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN5Q8TD22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN5Q8TD22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN5Q8TD22 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN5Q8TD22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN5Q8TD22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN5Q8TD22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN5Q8TD22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFXN5Q8TD22 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN5Q8TD22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms