Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPPL3Q8TCT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPPL3Q8TCT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPPL3Q8TCT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPPL3Q8TCT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms