Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RP9Q8TA86 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms