Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYRIPQ8NFW9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYRIPQ8NFW9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms