Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEST4Q8NFU0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BEST4Q8NFU0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms