Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRPV1Q8NER1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPV1Q8NER1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPV1Q8NER1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPV1Q8NER1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms