Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC155Q8N6L0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC155Q8N6L0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms