Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP1Q8N474 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFRP1Q8N474 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms