Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00528Q8N1L1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00528Q8N1L1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.5 ms