Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FUNDC1Q8IVP5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms