Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBEC3FQ8IUX4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3FQ8IUX4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3FQ8IUX4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms