Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF3Q86WH2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASSF3Q86WH2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms