Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACS2Q86VP3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACS2Q86VP3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms