Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF39Q86UA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF39Q86UA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms