Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DHX29Q7Z478 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DHX29Q7Z478 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DHX29Q7Z478 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DHX29Q7Z478 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DHX29Q7Z478 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms