Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC11Q7Z392 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC11Q7Z392 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC11Q7Z392 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms