Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTF1AQ7RTS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTF1AQ7RTS3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PTF1AQ7RTS3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTF1AQ7RTS3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTF1AQ7RTS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTF1AQ7RTS3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTF1AQ7RTS3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTF1AQ7RTS3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms