Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYFIP1Q7L576 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CYFIP1Q7L576 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 457.5 ms