Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC80Q76M96 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC80Q76M96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms