Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00336Q6ZUF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00336Q6ZUF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms