Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDHR3Q6ZTQ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR3Q6ZTQ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR3Q6ZTQ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR3Q6ZTQ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR3Q6ZTQ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR3Q6ZTQ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR3Q6ZTQ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR3Q6ZTQ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR3Q6ZTQ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms