Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF493Q6ZR52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF493Q6ZR52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms