Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC2Q6ZN30 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC2Q6ZN30 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms