Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN5Q6U736 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN5Q6U736 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms