Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIY7

PAPD4, Poly(A) RNA polymerase GLD2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD4Q6PIY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPD4Q6PIY7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPD4Q6PIY7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms