Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA3EQ6PEY2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3EQ6PEY2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms