Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RFWD3Q6PCD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFWD3Q6PCD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFWD3Q6PCD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms