Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8BQ6P9F7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8BQ6P9F7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms