Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN3Q6P5Z2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKN3Q6P5Z2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms