Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A4Q6P1M0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A4Q6P1M0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms