Protein–RNA interactions for Protein: Q6P087

RPUSD3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase RPUSD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3Q6P087 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPUSD3Q6P087 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD3Q6P087 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms