Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT80Q6KB66 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms