Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCTP1Q6DN14 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCTP1Q6DN14 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms