Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPECC1LQ69YQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SPECC1LQ69YQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1LQ69YQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms