Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YOD1Q5VVQ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms