Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CFAP58Q5T655 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP58Q5T655 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms