Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIF1Q5T3J3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms