Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDLRAP1Q5SW96 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms