Protein–RNA interactions for Protein: Q5SGD2

PPM1L, Protein phosphatase 1L, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1LQ5SGD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1LQ5SGD2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PPM1LQ5SGD2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPM1LQ5SGD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1LQ5SGD2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms