Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC6Q5RKV6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC6Q5RKV6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms