Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNT1Q5JUK3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNT1Q5JUK3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms