Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGD3Q5JSP0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD3Q5JSP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms