Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF6Q58WW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF6Q58WW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF6Q58WW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms